為了給最疼愛的小老弟菜鳥（克裏斯多夫·奈茨 Christopher Knights 配音）慶生老大（湯姆·麥格拉思 Tom McGrath 配音）帶領菜鳥以及好搭檔科斯基（克裏斯·米勒 Chris Miller 配音）、瑞哥闖入了防守最嚴密的美國黃金儲備中心隻為找到金庫盡頭僅有的那台銷售炸薯條的自動販賣機誰知他們剛剛完成任務沒多久便被長著觸角的販賣機吞了進去隨後被運到一個神秘的所在在全封閉的設施內四隻企鵝見到了偽裝成基因遺傳科學家的章魚戴夫（約翰·馬爾科維奇 John Malkovich 配音）原來戴夫曾是動物園一隻明星章魚但隨著萌態十足的企鵝們的到來他便跌入了絕望的深穀因此戴夫潛心研製了可怕的血清發誓要向所有他曾待過的動物園中的企鵝展開報複老大和夥伴們在逃亡途中得到北風特工隊的救助而他們和這些高傲的特工隊員將分別阻止戴夫的陰謀……